Narzędzia użytkownika

Narzędzia witryny


graph_import_export

Różnice

Różnice między wybraną wersją a wersją aktualną.

Odnośnik do tego porównania

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
graph_import_export [2009/04/07 16:36]
sgasioro
graph_import_export [2009/04/10 12:53] (aktualna)
sgasioro
Linia 1: Linia 1:
 **Boost Graph Import Export** **Boost Graph Import Export**
  
-====== NIE SKOŃCZONE ====== +Biblioteki Boost Graph udostępniają mechanizmy odczytu i zapisy grafów do formatów GraphML oraz GraphVIZ.
  
 ====== Budowa biblioteki ====== ====== Budowa biblioteki ======
Linia 9: Linia 8:
 Istnieje duże prawdopodobieństwo,​ że opisana procedura nie rozwiąże wszystkich problemów, które się pojawią podczas próby doprowadzenia **read_graphml** do działania. Istnieje duże prawdopodobieństwo,​ że opisana procedura nie rozwiąże wszystkich problemów, które się pojawią podczas próby doprowadzenia **read_graphml** do działania.
  
-Musimy mieć biblioteki EXPAT (http://​sourceforge.net/​projects/​expat/​) i ustawic ​zmienne środowiskowe na odpowiednie ścieżki przed kompilacją bibliotek.+Musimy mieć biblioteki EXPAT (http://​sourceforge.net/​projects/​expat/​) i ustawić ​zmienne środowiskowe na odpowiednie ścieżki przed kompilacją bibliotek.
 np. (ważne cudzysłowy):​\\ np. (ważne cudzysłowy):​\\
 set EXPAT_INCLUDE="​...\Expat 2.0.1\Source\lib"​\\ set EXPAT_INCLUDE="​...\Expat 2.0.1\Source\lib"​\\
Linia 17: Linia 16:
 W odpowiednim katalogu ...\boost\libs\graph\build wywołujemy **bjam**. W odpowiednim katalogu ...\boost\libs\graph\build wywołujemy **bjam**.
 Jeśli pojawiło się ostrzeżenie o braku ścieżek EXPAT ustawiamy je ponownie. Jeśli pojawiło się ostrzeżenie o braku ścieżek EXPAT ustawiamy je ponownie.
-Sprawdzamy czy nie pojawiły się błędy i jęsli są to je korygujemy (np. nieznaleziono ​expat.h) ustawiając odpowiednie ścieżki EXPAT, include w kompilatorze itp. +Sprawdzamy czy nie pojawiły się błędy i jęsli są to je korygujemy (np. nie znaleziono ​expat.h) ustawiając odpowiednie ścieżki EXPAT, include w kompilatorze itp. 
-Jeśli kompilacja się nie powiodłą z powodu braku biblioteki expat.lib otwieramy plik **.../​boost/​libs/​graph/​build/​Jamfile.v2** i zmieniamy **<​find-shared-library>​expat** na **<​find-shared-library>​libexpat** lub inne np. libexpatMT, libexpatw, libexpatwMT w zależności od naszego celu (czy biblioteka wielowątkowa,​ czy debug itd.).+Jeśli kompilacja się nie powiodą z powodu braku biblioteki expat.lib otwieramy plik **.../​boost/​libs/​graph/​build/​Jamfile.v2** i zmieniamy **<​find-shared-library>​expat** na **<​find-shared-library>​libexpat** lub inne np. libexpatMT, libexpatw, libexpatwMT w zależności od naszego celu (czy biblioteka wielowątkowa,​ czy debug itd.).
  
 Kolejna przydatną rzeczą jest po linii **<​define>​BOOST_GRAPH_NO_LIB** dodanie **<​define>​XML_STATIC**,​ dzięki czemu nie będziemy musieli mieć pliki **libexpat.dll** przy uruchamianiu programu. Kolejna przydatną rzeczą jest po linii **<​define>​BOOST_GRAPH_NO_LIB** dodanie **<​define>​XML_STATIC**,​ dzięki czemu nie będziemy musieli mieć pliki **libexpat.dll** przy uruchamianiu programu.
Linia 27: Linia 26:
 Do kompilacji potrzebne jest również dołączenie biblioteki **libexpat.lib**. Do kompilacji potrzebne jest również dołączenie biblioteki **libexpat.lib**.
  
-Jeśli jednak chcemy mieć tylko jedne biblioteki Boost, musimy zbudować całe biblioteki Boost, w tym celu w katalogu **.../​boost/​** wywołujemy **bjam** z odpowiednimi parametrami (instrukcja w Getting Started). ​Pamietajmy ​ustwieniu ​zmiennych **EXPAT_INCLUDE** i **EXPAT_LIBPATH** przed wywołaniem **bjam**.+Jeśli jednak chcemy mieć tylko jedne biblioteki Boost, musimy zbudować całe biblioteki Boost, w tym celu w katalogu **.../​boost/​** wywołujemy **bjam** z odpowiednimi parametrami (instrukcja w Getting Started). ​Pamiętajmy ​ustawieniu ​zmiennych **EXPAT_INCLUDE** i **EXPAT_LIBPATH** przed wywołaniem **bjam**.
  
 Dobrze jest jednak najpierw skompilować samą bibliotekę Graph by zobaczyć czy kompiluje się bez błędów, ponieważ jeśli pojawią się błędy np. związane z biblioteką EXPAT, biblioteki Boost zbudują się bez obsługi GraphML readera. Dobrze jest jednak najpierw skompilować samą bibliotekę Graph by zobaczyć czy kompiluje się bez błędów, ponieważ jeśli pojawią się błędy np. związane z biblioteką EXPAT, biblioteki Boost zbudują się bez obsługi GraphML readera.
  
 +====== Ograniczenia ======
  
- +Wczytywanie różnych grafów, np. z plików znalezionych w internecie, wymaga określenia różnych parametrów,​ co w praktyce wiąże się z zajrzeniem do pliku z grafem i ręczne określenie np. co jest głownym identyfikatorem węzła lub jakie każdy węzeł lub krawędź ma właściwości (np. "​name",​ "​color",​ "​weight"​). Nie ma jednej funkcji do wczytania dowolnego grafu, a przynajmniej nie ma takiej opisanej ​w dokumentacji. Jest to z góry narzucone przez niefortunny ​sposób opisu grafów w tych bibliotekach,​ który zakłada, że atrybuty grafu będą znane podczas kompilacji.
-Wczytywanie różnych grafów, np. z plików znalezionych w internecie, wymaga określenia różnych parametrów,​ co w praktyce wiąże się z zajrzeniem do pliku z grafem i ręczne określenie np. co jest głownym identyfikatorem węzła lub jakie każdy węzeł lub krawędź ma właściwości (np. "​name",​ "​color",​ "​weight"​). Nie ma jednej funkcji do wczytania dowolnego grafu, a przynajmniej nie jest taka opisana ​w dokumentacji. Jest to z góry narzucone przez niefortuny ​sposób opisu grafów w tych bibliotekach,​ który zakłada, że atrybuty grafu będą znane podczas kompilacji.+
 Jest to wielka wada, gdyż praktycznie uniemożliwia wykorzystanie tej biblioteki do wczytywania grafów stworzonych przez innych. Jest to wielka wada, gdyż praktycznie uniemożliwia wykorzystanie tej biblioteki do wczytywania grafów stworzonych przez innych.
 +
 +====== Przykład ======
 +
 +<code cpp>
 +#include <​iostream>​
 +#include <​string>​
 +#include <​boost/​graph/​graphml.hpp>​
 +
 +using namespace std;
 +using namespace boost;
 +
 +// definiujemy typ grafu
 +typedef adjacency_list<​ vecS, vecS, directedS,
 +    property<​ vertex_name_t,​ string >,
 +    property<​ edge_weight_t,​ int >
 +    > Graph;
 +
 +void CreateGraph(Graph &g, dynamic_properties &dp)
 +{
 + // nazwy wierzcholkow
 + const char* name[] = { "​0",​ "​1",​ "​2",​ "​3",​ "​4",​ "​5",​ "​6",​ "​7",​ "​8",​ "​9",​ "​10"​ };
 +
 + // definiujemy typ krawedzi
 + typedef std::​pair<​int,​int>​ Edge;
 +
 + // tworzymy krawedzie grafu
 + Edge my_edges[] = {
 + Edge(0, 1),
 +        Edge(1, 2), Edge(1, 5), Edge(1, 8),
 +        Edge(2, 3),
 +        Edge(3, 2), Edge(3, 4), Edge(3, 6),
 +        Edge(6, 7),
 + Edge(7, 8),
 +        Edge(8, 7),
 +        Edge(9, 10),
 +        Edge(10, 9)
 +     };
 +
 + // tworzymy wagi odpowienich krawedzi
 + int my_wages[] = {
 + 4,
 + 2, 1, 5,
 + 3,
 + 3, 1, 2,
 + 9,
 + 2,
 + 2,
 + 6,
 + 6
 + };
 +
 + // ilosc krawedzi
 + const int nedges = sizeof(my_edges)/​sizeof(Edge);​
 +
 + // tworzymy graf z wierzcholkow
 + g = Graph(my_edges,​ my_edges + nedges, 10);
 +
 + // ustawiamy wartosci wierzcholkow (tutaj np. stringi)
 + graph_traits<​Graph>::​vertex_iterator v, v_end;
 + for (tie(v,​v_end) = vertices(g);​ v != v_end; ++v)
 +     put(vertex_name_t(),​ g, *v, name[*v]);
 +
 + // ustawiamy wagi krawedzi
 + graph_traits<​Graph>::​edge_iterator e, e_end;
 + int index = 0;
 + for (tie(e,​e_end) = edges(g); e != e_end; ++e, ++index)
 +     put(edge_weight_t(),​ g, *e, my_wages[index]);​
 +
 + // ustawiamy, ze wierzcholki beda mialy pole name a krawedzie weight
 + dp.property("​name",​ get(vertex_name_t(),​ g));
 + dp.property("​weight",​ get(edge_weight_t(),​ g));
 +}
 +
 +void SaveGraphML(Graph &g, dynamic_properties &dp, const char *filename)
 +{
 + ofstream ofile(filename);​
 +
 + // skladnia:
 + //void write_graphml(std::​ostream&​ out, const Graph& g, const dynamic_properties&​ dp,
 + //          bool ordered_vertices=false)
 +
 + // zapis do strumienia
 + write_graphml(ofile,​ g, dp, true);
 +
 + ofile.close();​
 +}
 +
 +void LoadGraphML(Graph &g, dynamic_properties &dp, const char *filename)
 +{
 + ifstream ifile(filename);​
 +
 + // musimy dodac wlasnosci recznie
 + dp.property("​name",​ get(vertex_name_t(),​ g));
 + dp.property("​weight",​ get(edge_weight_t(),​ g));
 +
 + // lapiemy mozliwe wyjatki
 + try
 + {
 + read_graphml(ifile,​ g, dp);
 + }
 + catch (bad_parallel_edge &ge)
 + {
 + cout << "​bad_parallel_edge from " << ge.from << " to " << ge.to << endl;
 + }
 + catch (directed_graph_error&​)
 + {
 + cout << "​directed_graph_error"​ << endl;
 + }
 + catch (undirected_graph_error&​)
 + {
 + cout << "​undirected_graph_error"​ << endl;
 + }
 + catch (parse_error&​)
 + {
 + cout << "​parse_error"​ << endl;
 + }
 + catch (property_not_found &ge)
 + {
 + cout << "​property_not_found " << ge.property << endl;
 + }
 +
 + ifile.close();​
 +}
 +
 +void SaveGraphVIZ(Graph &g, dynamic_properties &dp, const char *filename)
 +{
 + ofstream ofile(filename);​
 +
 + // zapis do strumienia, "​name"​ jako identyfikator wezla
 + write_graphviz(ofile,​ g, dp, string("​name"​));​
 +
 + ofile.close();​
 +}
 +
 +void LoadGraphVIZ(Graph &g, dynamic_properties &dp, const char *filename)
 +{
 + ifstream ifile(filename);​
 +
 + // nalezy recznie dodac wlasnosci
 + dp.property("​name",​ get(vertex_name_t(),​ g));
 + dp.property("​weight",​ get(edge_weight_t(),​ g));
 +
 + // skladnia:
 + // bool read_graphviz(std::​istream&​ in, MutableGraph&​ graph,
 + //               ​dynamic_properties&​ dp,
 + //               ​std::​string const& node_id = "​node_id"​) ​
 +
 + // lapiemy mozliwe wyjatki
 + try
 + {
 + // odczyt ze strumienia, "​name"​ jako identyfikator wezla
 + read_graphviz(ifile,​ g, dp, "​name"​);​
 + }
 + catch (bad_parallel_edge &ge)
 + {
 + cout << "​bad_parallel_edge from " << ge.from << " to " << ge.to << endl;
 + }
 + catch (directed_graph_error&​)
 + {
 + cout << "​directed_graph_error"​ << endl;
 + }
 + catch (undirected_graph_error&​)
 + {
 + cout << "​undirected_graph_error"​ << endl;
 + }
 + catch (parse_error&​)
 + {
 + cout << "​parse_error"​ << endl;
 + }
 + catch (property_not_found &ge)
 + {
 + cout << "​property_not_found " << ge.property << endl;
 + }
 +
 + ifile.close();​
 +}
 +
 +void CheckGraphs(Graph &g1, Graph &g2)
 +{
 + assert(num_vertices(g2) == num_vertices(g1));​
 + assert(num_edges(g2) == num_edges(g1));​
 +
 + graph_traits<​Graph>::​vertex_iterator v, v_end;
 + for (tie(v,​v_end) = vertices(g1);​ v != v_end; ++v)
 +        assert(get(vertex_name_t(),​ g1, *v) == get(vertex_name_t(),​ g2, *v));
 +
 + graph_traits<​Graph>::​edge_iterator e, e_end;
 + for (tie(e,​e_end) = edges(g1); e != e_end; ++e)
 +        assert(get(edge_weight_t(),​ g1, *e) == get(edge_weight_t(),​ g2, *e));
 +}
 +
 +int main(int argc, char *argv[])
 +{
 + Graph g;
 + dynamic_properties dp;
 + CreateGraph(g,​ dp);
 +
 + // zapisujemy graph do pliku
 + SaveGraphML(g,​ dp, "​graph.xml"​);​
 +
 + // odczytujemy nowy graf
 + Graph g2;
 + dynamic_properties dp2;   
 + LoadGraphML(g2,​ dp2, "​graph.xml"​);​
 +
 + // sprawdzenie czy dobrze zostalo zapisane i wczytane
 + CheckGraphs(g,​ g2);
 +
 + // --------------------------------------------------
 +
 + // zapisujemy graph do pliku
 + SaveGraphVIZ(g,​ dp, "​graph_viz.dot"​);​
 +
 + Graph g3;
 + dynamic_properties dp3;   
 + LoadGraphVIZ(g3,​ dp3, "​graph_viz.dot"​);​
 +
 + // sprawdzenie czy dobrze zostalo zapisane i wczytane
 + CheckGraphs(g,​ g3);
 +
 + // wypisujemy na ekran
 + write_graphml(cout,​ g3, dp3, true);
 +
 + return 0;
 +}
 +</​code>​
 +
 +
 +Graf użyty w przykładzie w kodzie:\\
 +{{:​graf1.gif|}}
 +
graph_import_export.1239114963.txt.gz · ostatnio zmienione: 2009/04/07 16:36 przez sgasioro